O Viveiro Florestal da Fazenda Água Limpa encontra-se em processo de revitalização, sendo implantado projeto de irrigação dentro das casas de vegetação para atender de forma mais eficiente a demanda de produção de mudas de espécies arbóreas e florestais do bioma Cerrado e outros, a serem empregadas em áreas degradadas dentro da própria FAL e entorno, bem como projetos de educação ambiental das escolas públicas vizinhas a área da mesma, reforma de talhões de áreas experimentais, enriquecimento florestal, além de espaço para aulas práticas para diversas disciplinas da graduação e pós-graduação do EFL e outros departamentos parceiros, entre outros. 

Dentro do espaço do viveiros florestal, além das edificações necessárias, como almoxarifado e depósitos de materiais, canteiros e casas de vegetação, também tem um galpão multiuso, onde se realiza o beneficiamento das sementes e também é possível ministrar aulas (práticas).